Организовать убийство, согласно материалам дела, политикам помог начальник Байкальского городского отдела милиции Слюдянского ОВД Валерий Карабанов. Карабанов проник в дом депутата и застрелил, за исполнение убийства он попросил у заказчиков 10 тысяч долларов США.
Мотивом преступления стала личная неприязнь экс-мэра Сайкова по отношению к несогласному с его политикой депутату. Бабученко неоднократно негативно высказывался о нарушениях законодательства и стал инициатором проверок возглавляемой Сайковым городской администрацией.
Почти год следствие не могло доказать причастность вышеозначенных лиц к преступлению. Задержат ьих смогли лишь в 2006 году. После этого суд трижды пытался доказать вину фигурантов дела. В 2088 году Сайков, Рамазанов и Карабанов были оправданы, тогда доказательная база была признана недостаточной. Оправдательный вердикт развернул Верховный суд РФ по предоставлению кассации от прокуратуры.
В настоящее время областной иркутский суд признал виновными в организации убийства по найму (ч. 3 ст. 33, п. «з» ч. 2 ст. 105 УК РФ) Василия Сайкова и Хасана Рамазанова, приговорив их к 12 и 9 годам лишения свободы. Исполнитель, Валерий Кабанов получил 17 лет заключения. Сроки все осужденные будут отбывать в колониях строгого режима. Приговор вступил в силу.